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戴、刘二人假节领兵出镇，名义上是对付北方的少数族，实际上是司马睿在继司马承出镇湘州后的另一防范王敦的重要军事部署。在戴渊为都督的四州中，包括祖逖所在的豫州。朝廷对祖逖在北方所受的艰辛向来不闻不问，而在披荆斩棘收复了大片河南领土之后，却派人对他进行管辖，这使得祖逖怏怏不快。他认为，戴渊虽有才望，但由于是江南人，素无宏图远见，对北伐事业既会不关心，也可能不理解。特别是祖逖得知王敦与朝廷的矛盾已是一触即发，戴渊出镇是专为对付江州而来时，更感到灰心丧气。祖逖预感到，东晋将有一场内战，北伐事业难以成功了。他悒愤成疾，终于发病而死。祖逖之死，使王敦如释重负。对于发动兵变，他再没有任何永昌元年（322）正月，王敦以诛刘隗为名，从武昌起兵向建康进攻。在王敦为刘隗开列的大量罪状中，最主要的一条就是取奴为兵。显然，王敦以此争取大族对他起兵的支持。王敦声言，他身为宰辅，不能坐视刘隗误国。他还指斥司马睿“弃忽忠言，遂信奸佞”，并表示，不杀刘隗绝不罢兵，“隗首朝悬，诸军夕退”（《晋书·王敦传》）。在王敦起兵的同时，他的心腹沈充从吴兴起兵进行响应。三月，王敦带兵行至芜湖，复上书司马睿要求惩办刁协。司马睿一面命令刘隗、戴渊还军保卫建康，一面下诏讨伐王敦。王敦突然起兵，给王导带来很大困难。他每天一早就带上兄弟子侄在皇宫门前请罪，以避免举族受诛。在周f的申救下，司马睿任命王导为前锋大都督，同时，他加封戴渊为骠骑将军，周f为尚书左仆射，王邃为右仆射，分别统领军队。司马睿又加封周札为右将军，与刘隗分别守卫建康城的两个军事要塞——石头城和金城。司马睿还授以梁州刺史甘卓为镇南大将军、侍中、都督荆梁二州诸军事的职务，改调陶侃为江州刺史，命令他们各率所部攻打王敦的后方。
王敦的军队到达建康，周札不战而降，石头城落入王敦之手。司马睿连派刁协、刘隗、戴渊等人*，结果都未能成功。王敦攻入建康后，对司马睿不理不睬，却放兵四处劫掠。司马睿的人身安全受到威胁，他派人转告王敦说：“如果你没有忘掉朝廷的话，请马上息兵。你要有别的打算，我可以退居琅邪国为你让路。”司马睿见到败退回宫的刘隗、刁协，拉着他们的手，痛哭流涕。他亲自准备了马匹、人力，催促他们逃走。后来，刘隗逃奔到石勒那里；刁协则中途为人杀死。不久，在建康之外反对王敦起兵的各路州镇也陆续遭到失败，湘州刺史司马承、梁州刺史甘卓先后被杀，陶侃则退回广州。
王敦控制了朝政。他先后将戴渊、周f等人杀死，并“改易百官及诸军镇，转徙黜免者以百数，或朝行暮改，惟意所欲”（《资治通鉴》卷九二）。他还把司马睿软禁在宫中，取消了人身自由。四月，王敦退军还武昌，临行前又在京城设置了留府，以控制朝廷。不久，王敦加领宁益二州都督，并把几个军事重镇全部换上自己的亲属或心腹。在王敦看来，改朝换代已是唾手可得的事情了。
永昌元年十一月，司马睿由于极度痛苦，心力交瘁，病死在宫中，时年四十七岁。马司睿死后，其子司马绍嗣位，是为明帝。明帝即位后二年，依靠其他大族的支持，将第二次起兵企图篡夺帝位的王敦击败。
………【第二十六篇 司马曜】………
晋孝武帝司马曜，字昌明，（361年…396年11月6日）是东晋的第九个皇帝，在位时间是372年至396年。他是晋简文帝的第三个儿子，晋安帝和晋恭帝的父亲，母李陵容。
晋孝武帝四岁时被封为会稽王，372年被立为太子，同年晋简文帝逝，他继位，当时才11岁。第二年立年号为宁康。一开始由太后摄政。14岁时（376年）开始亲政，改年号为太元。当年他改革收税的方法，放弃以田地多少来收税的方法，改为王公以下每人收米三斛，在役的人不交税。此外他在他在位期间试图加强皇帝的权力和地位。383年前秦进攻晋，试图灭晋，在淝水之战中晋军大胜。
晋孝武帝即位时期由于税赋改革与谢安当国，被称为东晋末年的复兴；但是谢安死后司马道子当国，以及晋孝武帝嗜酒成性，《晋书》说“醒日既少”，优柔寡断，导致东晋政局再度陷入混乱。
晋孝武帝由于对他当时宠信的张贵人开玩笑说：“你已经快要三十岁了，按年龄应该要被废弃了”，导致当晚张贵人一怒之下杀了他。死后葬于今江苏南京的隆平陵。
宁康三年（375年），14岁的司马曜加元服，正式临朝亲政，改年号为太元，以谢安为辅政。太元三年（378年）春，帝移居会稽王邸。亲政的头三年，他改革收税的方法，放弃以田地多少来收税的方法，改为王公以下每人收米三斛，在役的人不交税，被称为东晋末年的复兴。但是后来孝武帝嗜酒成性，《晋书》说“醒日既少”，又优柔寡断，导致东晋政局再度陷入混乱。司马曜在亲政的同年八月，册立了他的皇后王法慧。王法慧是太守王蕴的女儿，比司马曜大三岁。当初议立皇后的时候，大家一致认为王家名声好，养出来的女儿也一定性情柔顺、四德俱全、可以母仪天下。然而这位王皇后却让所有的人都大失所望，她不但骄奢悍妒，而且还嗜酒，行为粗鲁，举止不端，尤其擅长借酒装疯，闹得司马曜的后宫鸡犬不宁。司马曜十分苦恼，只好向岳父王蕴求助，将自己的遭遇如此这般加以控诉一番。王蕴惶恐，也过意不去，摘下帽子向女婿皇帝赔礼道歉，此后王法慧略有收敛。5年之后，21岁的王皇后病逝，谥号“定皇后”，葬于隆平陵。18岁的孝武帝总算恢复了自由。
孝武帝司马曜，是东晋王朝比较有作为的皇帝。在他称帝的24年里，晋王朝多少出现了一些振兴之象，还曾经创造了军事史上的奇迹“淝水之战”。太元八年（383年），前秦苻坚“帅众渡淮，（司马曜）遣征讨都督谢石、冠军将军谢玄、辅国将军谢琰、西中郎将桓伊等距之。”“诸将及苻坚战于肥水，大破之，俘斩数万计，获坚舆辇（车驾，多为天子所乘）及云母车（帝后所乘）。”
淝水之战是中国历史上著名的战役，发生在东晋太元八年（383年）8月至12月。前秦苻坚下诏，大举攻晋，试图灭之，于是淝水大战爆发。苻坚亲率步兵60万、骑兵27万、羽林郎（禁卫军）3万，共90万大军从长安南下，绵延数千里，水陆齐进，仅运粮船只就有万艘。同时，苻坚又命梓潼太守裴元略率水师7万从巴蜀顺流东下，向建康进军。苻坚骄狂地宣称：“以吾之众旅，投鞭于江，足断其流。”这就是著名典故“投鞭断流”的来历。东晋北上抗击秦军的总共兵力才8万，在宰相谢安的主持下，以谢石为大都督，谢玄为前锋，主力军队就是闻名天下的北府兵。东晋建都建康（今南京），军府设在建康之北的广陵（今江苏扬州市），故称军府曰北府。
当时秦军前锋苻坚之弟苻融兵30万首先到达颍口（今安徽颍上县），秦军初战告捷，苻融攻占了寿阳（今安徽寿县），与此同时，秦军慕容垂部攻占了郧城（（今湖北郧县）。而且截断了东晋派来救援军胡彬的退路，将其团团包围在硖石（今安徽凤台西南）。苻融赶快送信给苻坚说：“敌人少而且易捕获，就是担心逃跑了，请赶快派大军过来。”苻坚见信大喜，灭东晋心切，留大军于项城，带轻骑八千赶到寿阳。这时候无论是苻坚或者是苻融都认为东晋已是刀翥之肉，于是派出原东晋太守朱序去劝降。朱序原是东晋襄阳守将，公元378年，苻坚派出大军围攻襄阳城，朱序顽强抵抗坚守了一年，朱序多次出城作战，屡破秦军。后来朱序部将李伯护秘密派其子送信秦军，愿做内应。苻坚派兵加紧攻城。城破后，苻坚没有杀他，反留在身边重用。
朱序到了谢玄营中，将秦军部署完全和盘托出。并建议，趁秦军未完全集结，迅速出击。谢石本来是打算坚守不战，听了朱序的话后，便改变了作战方针，决定主动出击。11月，谢玄派刘牢之率精兵五千到洛涧（在今安徽淮南东），秦将梁成率部5万隔洛涧布阵以待。刘牢之以兵五千就敢强渡洛水，去攻击对手的5万人马，而秦军也居然被杀得大败，被斩杀一万五千人，秦大将梁成也被刘牢之突入阵内一槊刺死。这场战役下来，秦军有10多个将领被杀。
洛涧大捷后，令晋军信心倍增。谢石继续挥军水陆并进，直抵淝水（今安徽寿县南瓦埠湖一带）东岸，在八公山边扎下大营，与寿阳的秦军隔岸对峙。由于秦军紧逼淝水西岸布阵，扼守着淝水，晋军无法渡河。双方力量对比悬殊，又不容许晋