城前，当时的内阁首辅东林党人钱龙锡和袁崇焕长谈一夜。在那个黑漆漆的夜里，一个密谋诞生了。
该密谋指向的就是名震朝野、也有一把尚方宝剑的平辽将军、左都督毛文龙。此人曾在辽东巡抚王化贞手下担任过都司。天启元年（1621年）五月，他率领二百名士兵，涉海三千里，直入虎穴，于镇江活捉了叛将佟养真，一举收复了辽东半岛数百里。
这件事在明帝国的影响力并不次于袁崇焕后来的宁远大捷，因为在毛文龙收复辽东半岛之前，明军无一胜，后金无一负，而毛文龙却只用了二百人就改变了这种局面。自此，毛文龙开始了他的皮岛复兴事业。从万历四十八年（1620年）十月到崇祯元年（1628年）十月，毛文龙用了八年时间与满洲人进行了无数次不同程度的交锋，并胜多败少。明帝国大喜，令其驻镇皮岛，任务很简单，牵制满洲。
袁崇焕出关后，宁远、锦州立刻发生兵变。他赶紧抽出两个月时间来，才把兵变平息，收拾停当完关宁兵马后，满洲人又没有来进攻，他开始实施他的阴谋。
他当时大概并没有想杀毛文龙，因为当初，他和朝中大臣讲过，他会慢慢收拾毛文龙的。朝中大臣们很高兴。从这件事上就可以看出，毛文龙这个家伙很不会为人处世，有关他的记述中，也的确能证明这一点，此人是个很可爱的武夫，让他杀人放火可以，但让他对朝中那些只凭嘴巴工作的人礼貌有加，他绝对办不到。而且，让朝臣们最不能容忍的是，毛文龙总刻意地给他们一种感觉：我独霸一方，我只听皇上的。
这种感觉当然是毛文龙刻意做出来的，这就让许多大臣，尤其是在辽东的大将们很不舒服。钱龙锡后来问袁崇焕：“一旦这个家伙不听你的，你该怎么办。”袁崇焕说：“他的地盘在我管辖之内，如果他不老实，就干了他。”
这话出自一个书生之口，很让人惊讶。但一想想袁崇焕正以书生的身份在跟满洲人拼命，我们暂且原谅他。袁崇焕之所以想要干掉毛文龙，主要还有新官上任三把火的因素在里面。袁崇焕督师五镇，每一镇的总指挥虽然打仗不怎么样，但不受同僚管束的本事可不小，毛文龙正是这几个人中最棘手的一个，袁崇焕肯定要先对他下手。
另外，毛文龙抢了他一个风头，此恨在任何人看来，都是不可消除的。当初，说努尔哈赤在宁远城下狼狈逃走，并没有死。过不久，一条消息传进北京城，说努尔哈赤死了。京城一片叫好声，他们把这个满洲人的死归功于袁崇焕，即使不是大炮震死的，也是被大炮吓死的。可又过了不久，毛文龙上报朝廷，说努尔哈赤在宁远大败后就跑到了威宁堡狗儿岭泡汤泉了。在这个时候，他之所以有此闲情，是因为背后恶疮发作。毛文龙说，是自己派了一些士兵拿着火枪在山顶上放枪，努尔哈赤本来打了败仗就生气，又加上他们骚扰，以为明军大部队来了，心慌意乱，就在回沈阳的路上归西了。
毛文龙的意思是说，是我把他吓死的。这种意思谁都能明白，袁崇焕自然也明白。那么，在这之前传言的努尔哈赤被袁崇焕用大炮轰死或吓死的话也就不攻自破了。
其实，功劳并不分大小，要看在什么时候建的功劳。如果大家都在建功，你建的功劳再大，自然也不能脱颖而出。但是，如果只有你一个人建功的时候，此功劳无论大小，都是大功一件。
袁崇焕所面对的情况大概就是这样，所以，他很恨毛文龙。这种恨又加上毛文龙不给他面子，就造成了他把“慢慢收拾”变成了“杀之”了。
毛文龙不给他面子的事发生在天启年间。当时，袁崇焕镇守宁远。毛文龙手下一员将领，因过不惯岛上的日子，就领着一群同样过不惯的士兵跑去宁远。毛文龙知道后大怒，频频上疏请求皇上严处叛将。
擅杀毛文龙（2）
当时，这些人正在宁远城下，朝廷让袁崇焕把这些人收押起来的圣旨也到了宁远城。袁崇焕却做了个决定，以守城之名收下了这些人。
毛文龙更是大怒，袁崇焕却认为这是小事，大家都在为明朝皇帝打工，你的人自然就是我的人。便写信跟他解释，可毛文龙却把信撕了。袁崇焕知道后，恨得咬牙切齿。
当袁崇焕平息了宁远、锦州的兵变后，准备对毛文龙下手前，派了一名使者去皮岛视察工作，实际上是探一下虚实。
此使者大概是个对饮食很讲究的人，到了毛文龙部后，发现毛文龙请他吃的不是咸菜就是土豆。事实上，在宁远城，他也吃不到什么好东西，但总归是有点肉丝的。况且，来者是客，你毛文龙就是在屁股上割下一块肉来，也是回事啊。吃了几天后，他觉得毛文龙是故意的。当然，毛文龙的脾气他早有耳闻，对任何人都不放在心上，用他的话来讲就是傲慢无礼。
当他一确定这种傲慢无礼真的就是指向他的时候，他大怒。我们说，小人的怒气是很凶，但他自己永远也不能为自己出气。于是，他就把袁崇焕搬了出来。毛文龙自然不理会这套，在毛大帅看来，皇帝老儿来了也是这个，皮岛就是这么穷。这个使者跑回了宁远，把自己所受到的羞辱嫁接给了袁崇焕，说毛文龙无礼藐视督师。
袁崇焕几乎气疯，换作任何人，自己的狗被人欺负了，自己如果不做点什么，还叫人吗？袁崇焕自然也不例外。毛文龙的厄运就在这个时候开始了。
我们说，私人的成见和狭隘的报复心态使得袁崇焕做出了一件对他对大明极为不利的事情，从中可以看出，个人的力量往往影响甚至偶尔可能决定着历史的进程。
袁崇焕，曾经被英雄的光环笼罩了几百年。这种光环太耀眼了，把他后来做的一件事几乎遮盖得一丝光亮都没有透出来。
袁崇焕毕竟是一书生，但也正因为读过数年书，所以对阴谋之研究有很深的造诣。他觉得如果把毛文龙招来宁远杀掉，皮岛的那群士兵很可能会造反。所以，他决定亲自到毛文龙家门口把他干掉。他并非是想证明自己勇敢，而是想让毛文龙的士兵知道，他们的主帅该杀。
袁崇焕在崇祯二年（1629年）五月二十九日抵达毛文龙的管辖区之双岛，但他并没有上岸，而是在舟中住了下来。离此岛只有半天路程的毛文龙第二天赶到迎接袁崇焕，并呈上一些好吃的，以表欢迎之意。两人像多年未见的好朋友，来到陆地毛文龙的军帐中开始讲话。
袁崇焕吹牛的本性在第一句话就暴露出来，他说，当今天下，辽东一地，陆路在我，水路有你，可谓珠联璧合。
毛文龙惶恐得直哆嗦，他虽然平时骄横跋扈，但绝对不妄自尊大。他立即回道：“我在海外已经八年，以海水为牛奶乃家常便饭。虽然也想为朝廷出力，无奈粮草兵器难以供应，所以，很是惭愧。”
袁崇焕见毛文龙的话语倒是很恭敬，就站了起来，说：“明天我准备请你吃饭，但我在船上吃饭就晕，希望能借你帐房一用。”
毛文龙回答：“没有问题。”
六月三日，袁崇焕在毛文龙率领的皮岛官兵列队欢迎中走上岸来，进了毛文龙的帐房。两个人开始一面吃，一面谈心，谈着谈着，袁崇焕就把目的说出来了：“杭州那个地方很不错，适合养老。不知你有兴趣否？”
毛文龙真想跳起来给袁崇焕一刀，你他妈的这是想让我滚蛋啊，这不可能啊，“杭州地方是不错，可在这个地方也只有我能牵制住东夷”。
袁崇焕忽然发现面前这位也是大话王，“朝廷自会派人来接替你。”
毛文龙冷冷一笑，很自负地说道：“是吗？谁？”
袁崇焕接不上来了，他本想说是自己，但太直接了，反应灵敏的他立即说道：“我准备给你的士兵每人一两银子，你把花名册给我。”
毛文龙道：“还用什么花名册，在双岛的只有三千五百名。明天我就先替他们领了。”
擅杀毛文龙（3）
两个人的谈话并不顺利，六月五日，袁崇焕犒赏完官兵，就让毛文龙把将领们叫进了帐篷。袁崇焕一一问其姓名，这些人虽名不同，但都姓毛。
毛文龙解释说：“这都是我的子孙们的亲戚。”
袁崇焕立即说道：“我宁远的官有许多薪水，兵有许多粮，还天天吵着饿。你们在海外，每月却只得这么一点东西，真是让我很难过。请受我一拜。”
毛文龙正要说点什么，大概是想替兄弟们谢谢这位督师，想不到袁督师突然一声喝：“拿下！”
毛文龙还没有回过神来，袁崇焕的几名手下已经将其拿下，袁崇焕请出尚方宝剑，面向京城方向（在这个时候，他还能辨别东南西北，可见其聪明）道：“绑了，脱掉官服！”
然后就是宣布毛文龙的十二大罪状，欲通敌谋反、贪污、不遵守朝廷纪律这些肯定是在其中的了，为了凑足十二条，连毛文龙娶下属的小妾这一事都成了罪状。这些罪状毛文龙一条都不承认。有的纯粹是袁崇焕胡说出来的，有的则是当时辽东将领的普遍现象。毛文龙为什么要认？他不认不要紧，要紧的是，他和他的手下已经被袁崇焕制服。
袁崇焕又开始说大话，“你以为我是个书生就好欺负吗？我告诉你，我乃朝廷一个首将。今日我杀了你，如果我不能在五年之内恢复全辽以还朝廷，我就用砍你的这把尚方宝剑砍了自己！”
这个时候的毛文龙对袁崇焕的大话早就不感兴趣了，他想知道的是，袁崇焕杀他到底是袁崇焕的意思还是皇上的意思。可袁崇焕就是不告诉他，跪在地上向着京城方向请旨：“我今天诛毛文龙，只因他独霸一方，不听朝廷命，以肃军政，各镇守将中如果再有如毛文龙者，照杀！”又吹牛：“臣五年不能平奴，求皇上亦以诛毛文龙者诛臣。”
说完这些，就命令旗牌官将毛文龙推出帐外，像杀猪一样杀掉了。