《人类灭绝》

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人类灭绝- 第21部分


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行了一系列操作。不熟悉电脑的研人压根儿不知道正勋要做什么。
大概半小时后,正勋转头对坐在地板上的研人说:“搞不懂。”
“果然棘手吧?”
正勋点头道:“我怀疑它坏了,但又不能百分百确定。”
“就是说,它可能坏了?”
“有可能。”正勋思索片刻,一向柔和的视线突然凌厉起来,那是研究人员所特有的表情,“借我一周时间,让我更仔细查验,行不?”
“唔……”研人也思索起来。父亲在遗言中告诫他绝不能将电脑交给别人,而且不久前还出了坂井友理那件事。倘若将笔记本电脑交给正勋,会不会也给他惹上麻烦呢?
“我想给你,但这不是我的机器,不能交给别人。”
“那就没办法了。”
“我们休息一会儿吧。”研人说,递给正勋一罐饮料。
研人趁休息间隙思考另一台电脑的问题。他想让正勋研究可能与其专业有关的“gift”软件,但又不知如何解释给他听。尽管一个月内开发出治疗绝症的特效药有如痴人说梦,但研人还是想听听正勋的看法。
研人认为韩国留学生值得信任,于是开口道:“咱们下面要谈的事,你能不能保密?”
正勋诧异地皱起眉,点了点头。
“我必须在一个月内制造出gpcr的激动剂。”
“什么?一个月?”
“不错。‘gift’软件就是达成这一目的的工具。”
研人简明扼要地介绍了父亲嘱咐他完成的奇怪研究。得知研人的父亲最近过世了,正勋由衷地表示慰问,此外就一直沉默着倾听。最后,当说到父亲的计划中缺失了制药的重要环节时,研人不禁感觉有点羞愧。“这行不通,对吧?我爸的专业是病毒学,他肯定想得太简单了。”然而,正勋并没有当即对研人父亲的方案予以否定。他的表情一本正经,应该正在开动脑筋思考。“那我就抛开固有观念,纯粹从逻辑角度谈谈。”
“请讲。”
“我明白你父亲制定这个计划时的想法。”
“什么?”研人惊愕地探出身子。
“成功实施这个看似不可能实现的计划的条件只有一个,即‘gift’这个软件十全十美。”
“十全十美?”
正勋点头道:“如果能准确建立受体模型,并完美设计出与其结合的药物的化学结构,那接下来只需按部就班地操作就行了。”
“就是说,接下来只需要按照药物的化学结构将其合成出来?”
“不错,所以说,你父亲制定的研究步骤,是成功合成药物的最基本条件。”
如果制药软件能生成完美的设计图,那合成出化合物就等于制造出药物。姑且不论假设是否成立,单从逻辑角度看,这一论断确实没错。
a4大小的白色笔记本电脑中有必要的软件,就使用这台笔记本吧。
原来父亲在遗书中,给出了充分的指示。正勋说得对,只要“gift”软件十全十美,父亲的计划肯定就能成功实施。
“可这个世界上有那么强大的软件吗?”
“没有。”正勋断然否定。
研人大失所望,“那逻辑上成立有什么用?”
“我那么说是出于对你父亲的尊敬。”正勋笑道,朝更大的电脑伸出手,“咱们看看‘gift’软件吧。”
电脑很快启动,屏幕上浮现出“变种gpr769”的cg图像。正勋惊叫起来:“这是什么?”
“从专业角度看,果然很奇怪?”
“我还从没见过如此真实的图像。唔……怎么说呢?这么设计还是有道理的。”
正勋注视着七个α螺旋组成的跨膜结构受体,过了好一阵子,他才移动鼠标,敲击键盘,确定“gift”的各项功能,嘴里不时嘟哝着“原来如此”或“怎么回事”,间或还笑出声来。查看完毕后,正勋说:“真是不可思议!这个软件领先了当今科学水平五十年。以现代人类的水平,不可能写出这样的软件。”
“就是说,它超越了人类智慧?”
“对,超越了人类的智慧。通过基因的碱基序列,就能知晓受体蛋白质的立体结构,从而设计与其结合的药物的化学结构,还可以预测药物与受体结合后的复合体的结构。对了,这是什么?”

第14章 海斯曼报告(13)

菜单中有一个写着“admet”的选项。这一术语同研人的专业有关。“这是吸收、分配、代谢、排泄和毒性等五个英文单词的首字母缩写,是药物进入体内后的状态指标。”
“哦……”正勋似乎明白了,“是药物在体内的动态和毒性吧?”
“这个软件,连‘admet’都可以预测?”
“嗯,光看这个功能,并没什么好稀奇,因为其他软件也能预测药物在体内的动态和毒性。但‘gift’还可以指定生物种类,选择人或鼠。还有基因组输入栏,必要时实施定制医疗。”
研人也开始真切意识到“gift”这个软件有多么不同寻常。“如果这个软件十全十美,那就不需要临床试验了。”
“嗯。整个制药工程都可以由这个万能软件承担。人要做的,只是合成药物和确认结果而已。”
研人和正勋相视而笑。
“接下来——”正勋再次看向电脑,似乎对这个神奇的软件倍感兴趣,“我们来找找这个软件并不完美的证据吧。你有什么好办法?”
“不知道这个有没有用?”研人将塞在书架上的一摞纸拿出来,那是实习医生吉原下载的肺泡上皮细胞硬化症的相关论文。“葡萄牙的研究人员发布了刚才提到的那种受体的立体结构。”
正勋浏览了一遍论文,喃喃道:“是同源建模啊?太好了。”然后反复比对“gift”中的图像。真实的cg图像变成了由球和带组成的抽象模型。将受体的活性部位放大后,与配体结合的部分就从原子层面上显示出来。
“果然如此。”正勋说,“两种模型差别很大。原子坐标的数值也不一样。”
“这么说,‘gift’是骗人的?”
正勋却苦着脸说:“现在还不知道。从逻辑上说,有三种可能:葡萄牙的研究人员错了,或者‘gift’错了,或者两者都错了。”
研人对正勋不肯轻易下判断的态度深表敬佩。强大的逻辑思维能力是科学工作者唯一的武器。
“其实,计算机辅助药物设计已经遇到了瓶颈。就算是最先进的软件,也很难准确预测膜蛋白质的立体结构。葡萄牙的博士多半也使用了错误的模型。”
正勋打开自己笔记本电脑中的软件,拷贝了碱基序列的信息,输入“gift”。“这种蛋白质的结构是已知的,我们来做个试验,对比一下‘gift’生成的结果吧。”
敲击回车键后,屏幕上出现了一串英文:请连入因特网。
“这是为什么?”正勋不解地问。
研人将高速因特网的网线接入a4大小的白色笔记本电脑。机器接入赛博空间后,“gift”的画面也改变了。
remaintime00:03:11
这个数字正在逐秒递减。
“只要三分钟?”正勋嘟哝道。
三分钟后,“gift”就给出了答案。窗口中浮现出正勋指定的蛋白质的立体结构。正勋仔细比对,神情越来越严肃。“奇怪,这个软件准确描绘了一百个氨基酸构成的蛋白质的结构。”
研人也惊讶不已。这不就证明了“gift”是完美的吗?
但正勋仍然没有立即下结论。
“我首先想到的是,这个软件是冒牌货。”
“那它怎么能模拟出蛋白质的结构?”
“它要求在计算时连上因特网,对吧?”
“嗯。”
“它可能找到网上已有的蛋白质结构,假装是自己计算的结果。只要接入蛋白质数据库,就能找到许多类似的信息。”
“原来如此。”研人说,但马上又发现了新问题,“可是这样一来,我们不是就无法判断‘gift’的真伪了吗?”
“不错。我们无法辨别‘gift’是自己计算出正确的结果,还是盗用了别人的发现,因为正确的结构只有一种。但如果计算未知的结构,那谁都不知道‘gift’和其他的模型谁对谁错。”
他们似乎中了一个狡猾至极的圈套。不过,倘若“gift”是冒牌货,那到底是谁出于何种目的,大费周章地开这种玩笑?
正勋问:“你父亲熟悉编程吗?”
“完全不懂。”
“那他是从哪里得到这个软件的?”
“不知道。”
礼物——这个软件的名字,渐渐飘散出阴森的气息。
“还有一种可能,即‘gift’确实是十全十美的。当然,这只是假设。”正勋强调道,“如果这一假设成立,那‘gift’就可能是装有云系统的黑客软件。”
“云系统?”
“是的。这是寻找外星人的‘seti计划’用的方法。要从宇宙电波中探测出可能是智慧生命发射的信号,需要异常庞大的计算量。于是该计划招募了大量志愿者,将他们的电脑联网,利用他们电脑cpu的一部分进行计算。数十万台电脑集中起来的话,其计算能力将超过超级计算机。”
“我能说句题外话吗?”
“可以。”
“他们有没有找到外星人?”
“还没有。”
研人有点失望。
“银河系中心发出的来历不明的电波,过去只检测出六次。现在这些电波仍然是个谜。世界各国的天文学家,已经制定了报告程序,应对找到外星人的情况。”
“哦。”
“言归正传。”
正勋迅速将关注点从外星人转移到“gift”上。
“决定软件性能的重要因素有两个:电脑的计算能力和算法。”
“算法指的就是计算步骤吧?”
“不错。省略无用的计算,用更少的步骤获得正确的答案。”
研人拼命思考,理解这些非专业知识。
“如果这台电脑接入了分布式计算系统,将计算任务分配给其他电脑,那计算能力就会大大提高。但是,即便将一亿台电脑连起来,也不可能完成分子动力学模拟计算。”
这一点研人也明白。正因为计算不完美,才要在制药过程中收集与结构活性相关的数据,研究更合适的化学结果。发达国家之所以争相研制超级计算机,也是因为计算能力与科学技术水平直接相关的时代已经来临。
“能弥补计算能力不足的,是简化计算步骤,也就是算法。尽管使用了各种方法,但完美的算法是不存在的。算法不同,答案也会不同

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