世宗《敬一箴》一卷，《注程子四箴》、《注范浚心箴》共二卷
孙作《东家子》一卷
叶仪《潜书》一卷
留睿《留子》一卷
叶子奇《太玄本旨》九卷
硃右《性理本原》三卷
张九韶《理学类编》八卷
谢应芳《辩惑编》四卷
周是修《纲常彝范》十二卷
曹端《理学要览》二卷，《夜行烛》一卷，《月川语录》一卷
尤文《语录》二卷
鲍宁《天原发微辨正》五卷
金润《心学探微》十二卷
吴与弼《康斋日录》一卷
薛瑄《读书录》十卷，《续录》十卷
周洪谟《南皋子杂言》二卷，《箐斋读书录》二卷
胡居仁《居业录》八卷
谢鐸《伊洛渊源续录》六卷
程敏政《道一编》五卷
蔡清《性理要解》二卷
杨廉《伊洛渊源录类增》十四卷，《畏轩劄记》三卷
张吉《陆学订疑》二卷
章懋《枫山语录》二卷
周木《延平问答续录》一卷
杨守阯《困学寡闻录》十卷
韩邦奇《性理三解》八卷
王鸿渐《读书记》二卷
王輶《大儒心学录》二十七卷
徐问《读书劄记》八卷，《续记》八卷
方鹏《观感录》十二卷
魏校《庄渠全书》十卷
陈献章《言行录》十卷，《附录》二卷
赵鹤《金华正学编》十卷
王守仁《传习录》四卷，《阳明则言》二卷
罗钦顺《困知记》六卷，《附录》二卷
陈建《学蔀通辨》十卷
许赞《性学编》一卷，《道统溯流录》一卷
湛若水《甘泉明论》十卷，《遵道录》十卷，《问辨录》六卷
黄佐《泰泉庸言》十二卷
吕柟《泾野子内篇》三十三卷，《语录》二十卷
邹守益《道南三书》三卷，《明道录》四卷
何瑭《柏斋三书》四卷
薛蕙《日录》五卷
顾应祥《惜阴录》十二卷
沈霁《语录》四卷
邵经邦《弘道录》五十七卷
唐顺之《儒编》六十卷
薛应旂《考亭渊源录》二十四卷，《薛子庸语》十卷
王艮《心斋语录》二卷
周思兼《学道记言》六卷
胡直《胡子衡齐》八卷
陆树声《汲古丛语》一卷
金贲亨《道南录》五卷，《台学源流集》七卷
尤时熙《拟学小记》八卷
刘元卿《诸儒学案》八卷
周琦《东溪日谈》十八卷
罗汝芳《明道录》八卷，《近溪集语》十二卷
耿定向《庸言》二卷，《雅言》一卷，《新语》一卷，《教学商求》一卷
李渭《先行录》十卷
王樵《劄记》一卷，《笔记》一卷
许孚远《语要》二卷
硃衡《道南源委录》十二卷
孙应鰲《论学汇编》八卷
梁斗辉《圣学正宗》二十卷
管志道《问辨牍》八卷，《理学酬咨录》八卷
王敬臣《俟后编》四卷
吕坤《呻吟语》四卷
邹德溥《畏圣录》二卷
邓球《理学宗旨》二卷
李材《教学录》十二卷，《南中问辨录》十卷
曾朝节《臆言》八卷
邹元标《仁文会语》四卷，《日新编》二卷
杨起元《证学编》二卷，《识仁编》二卷
徐即登《儒学明宗录》二十五卷
黄时熠《知非录》六卷
钱一本《黾记》四卷
顾宪成《劄记》十八卷，《东林商语》二卷，《证性编》八卷，《当下绎》一卷，《泾阳遗书》二十卷
李多见《学原前后编》八卷
涂宗浚《证学记》三卷
周子义《日录见闻》十卷
吴仕期《大儒敷言》三十三卷
徐三重《信古余论》八卷
来知德《日录》十二卷
方学渐《心学宗》四卷
姚舜牧《性理指归》二十八卷
冯从吾《元儒考略》四卷，《语录》六卷
唐鹤徵《宪世编》六卷
曾凤仪《明儒见道编》二卷
周汝登《圣学宗传》十八卷
高攀龙《就正录》二卷，《高子遗书》十二卷
孙慎行《困思抄》四卷
刘宗周《理学宗要》一卷，《证人要旨》一卷，《刘子遗书》四卷
叶秉敬《读书录钞》八卷
黄道周《榕坛问业》十八卷
章世纯《留书》十卷
黄淳耀《吾师录》一卷，《语录》一卷，《劄记》二卷
──右儒家类，一百四十部，一千二百三十卷。
太祖《资治通训》一卷，凡十四章，首君道，次臣道，又次民用、士用、工用、商用，皆著劝导之意。《公子书》一卷，训世臣。《务农技艺商贾书》一卷训庶民子弟。
成祖《务本之训》一卷采太祖创业事迹及往古兴亡得失为书，以训太孙
仁孝皇后《劝善书》二十卷
宋濂《燕书》一卷
王廉《迂论》十卷
叶子奇《草木子》八卷
王达《笔畴》二卷
曹安《谰言长语》二卷
赵弼《事物纪原删定》二十卷
解延年《物类集说》三十四卷
罗颀《梅山丛书》二百卷，《物原》二卷
谢理《东岑子》四卷
潘府《南山素言》一卷
何孟春《余冬序录》六十五卷，《闲日分义》一百卷
戴鱀《经济考略》二十卷
戴璟《博物策会》十七卷
陆深《同异录》一卷，《传疑录》二卷
孙宜《遁言》二卷
祝允明《前闻记》一卷，《读书笔记》一卷
蔡羽《太薮外史》五卷
刘绘《刘子通论》十卷
高岱《楚汉余谈》一卷
罗虞臣《原子》八卷
王杰《经济总论》十卷
汪坦《日知录》五卷
刘凤《刘子杂组》十卷
王世贞《劄记》二卷，《宛委余编》十九卷
王可大《国宪家猷》五十六卷万历中，御史言内阁丝纶簿猝无可考，惟是书载之。遂取以进。
沈津《百家类纂》四十卷
陈耀文《学圃萱苏》六卷，《学林就正》四卷
陈绛《金罍子》四十四卷
方弘静《千一录》二十六卷
劳堪《史编始事》二卷
陈其力《芸心识余》八卷
周祈《名义考》十二卷
詹景凤《詹氏小辨》六十四卷
穆希文《说原》十六卷，《动植记原》四卷
王三聘《事物考》八卷
徐常吉《诸家要旨》二卷
徐伯龄《蟫精隽》二十卷
赵士登《省身至言》十卷
刘仕义《知新录》二十四卷
屠隆《冥寥子》二卷，《鸿苞》四十八卷
闵文振《异物类苑》五卷
硃谋韦《玄览》八卷
赵枢生《含玄子》十六卷，《别编》十卷
吴安国《累瓦编》三十二卷
冯应京《经世实用编》二十八卷
柯寿恺《语丛》三十八卷
徐三重《鸿洲杂著》十八卷
王纳谏《会心言》四卷
沈节甫《纪录汇编》二百十六卷
祁承业《国朝徵信录》二百十二卷，《淡生堂余苑》六百四卷
董斯张《广博物志》五十卷
郑瑄《昨非庵日纂》六十卷
──右杂家类，六十七部，二千二百八十四卷。
刘基《多能鄙事》十二卷
周定王《救荒本草》四卷
宁献王《癯仙神隐书》四卷
杨溥《水云录》二卷
周履靖《茹草编》四卷
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顾清《田家月令》一卷
施大经《阅古农书》六卷
俞贞木《种树书》三卷
温纯《齐民要书》一卷
王世懋《学圃杂疏》三卷
黄省曾《稻品》一卷，《蚕经》一卷
李德绍《树艺考》二卷
袁黄《宝坻劝农书》二卷
陈鸣鹤《田家月令》一卷
宋公望《四时种植书》一卷
冯应京《月令广义》二十四卷
王象晋《群芳谱》二十八卷
徐光启《农政全书》六十卷，《农遗杂疏》五卷
张国维《农政全书》八卷
吴嘉言《四季须知》二卷
──右农家类，二十三部，一百九十一卷。
宋濂《萝山杂言》一卷
叶子奇《草木子余录》三卷
陶宗仪《辍耕录》三十卷，《说郛》一百二十卷又有《续说郛》四十六卷，明季人陶珽纂辑。
刘绩《霏雪录》二卷
陶辅《桑榆漫笔》一卷
瞿佑《香台集》三卷
张纶《林泉随笔》一卷
李贤《古穰杂录》二卷
岳正《类博杂言》二卷
叶盛《水东日记》三十八卷
单宇《菊坡丛话》二十六卷
陆容《菽园杂记》十五卷
姚福《青溪暇笔》二十卷
张志淳《南园漫录》十卷，《续录》十卷
梅纯《续百川学海》一百卷
王锜《寓圃杂记》十卷
罗凤《漫录》三十卷
李诩《漫笔》八卷
徐泰《玉池谈屑》四卷
罗钦德《闲中琐录》二卷
王涣《墨池琐录》三卷
沈周《客坐新闻》二十二卷
都邛《三余赘笔》二卷
都穆《奚囊续要》二十卷
徐祯卿《异林》一卷
唐锦《龙江梦余录》四卷
戴冠《笔记》十卷
侯甸《西樵野记》十卷
陆粲《庚巳编》十卷
陆深《俨山外集》四十卷
马攀龙《株守谈略》四卷
陆采《天池声隽》四十卷
胡侍《野谈》六卷
杨慎《丹铅总录》二十七卷，《续录》十二卷，《余录》十七卷，《新录》七卷，《闰录》九卷，《卮言》四卷《谈菀醍醐》九卷，《艺林伐山》二十卷，《墐户录》一卷，《清暑录》二卷
陆楫《古今说海》一百四十二卷
陈霆《两山墨谈》十八卷
司马泰《广说郛》八十卷，《古今汇说》六十卷，《再续百川学海》八十卷，《三续三十卷，《史流十品》一百卷
王文禄《明世学山》五十卷
尤镗《红箱集》五十卷
硃应辰《漫钞》十卷