的报告之前，塔列朗就已经向督政府递交了征服埃及的正式建议书。
该建议书提醒五人执政团：土耳其是在16世纪初征服埃及的，埃及并非一直是土耳其的领地，法国现在有责任干涉那些难以控制的无法无天的省份，并以土耳其的名义对其执行管理。这一奇特行动的公开理由有两个方面：整个埃及对于法国商人的偏见，包括马穆鲁克⑦强行勒索“贷款”以及两次当众侮辱殴打法国总领事马嘉隆的事件。外交部长坚持认为这是不可容忍的。军事干预的结果法国必将获得足够的补偿，埃及可以为法国提供“世界上气候最好的地方”，更不用提丰富的物产了——“谷物和蔬菜是最丰富的”——包括水稻、藏红花、蔗糖、咖啡和棉花。至于奥斯曼（土耳其）苏丹对法国宣战的问题，塔列朗加紧告诉谨慎的督政府：“他不会如此做的。”因为目前风雨飘摇的奥斯曼帝国，特别是阿尔巴尼亚和马其顿正在洪水泛滥，土耳其人自顾不暇。“同时英国人也不能恫吓我们，”他继续道，“因为我们和英国的战争为法国入侵埃及造成了绝好的机会。他们必须随时提防法国在海峡发动突然袭击的威胁，他们不可能将守卫海峡的海军战舰派到埃及去和我们打仗。”此外，一旦在埃及站稳脚跟，法国就能够从苏伊士派出15；000人的部队“将英国人赶出印度”。法国在埃及会遇到什么样的抵抗？他答道：“最多是8；000名马穆鲁克骑兵，而且完全不懂现代战术。”法国只需要25；000人便能占领这个国家，只要“5艘船和6艘三桅快舰就足以护送我们的远征军了”。至于统治埃及的马穆鲁克，会遭到被奴役的埃及人民的摒弃，“当我们将他们从压迫者的统治中解放出来时，他们会欢欣鼓舞的”。至于说到入侵，是“轻而易举的事……法国只需要花费少量的钱，不用多久共和国就会（从战利品之类的东西中）得到全部的回报的”。总之，外交部长论述道：“征服埃及将是对土耳其政府冒犯我们的错误行为的惩戒……埃及曾经是罗马帝国的一个省，现在它必将成为我们的一个省。”
就这样，督政府决定暂缓执行进攻英国的计划，而集中兵力进攻埃及。为了获得光荣、财富、权力和可能与英国达成的和平，同时也为了除掉对他们具有极大威胁的拿破仑将军，这是惟一可行的安排。毕竟由于与奥地利签订了和平协定，目前欧洲只需要少量的军队，而且一旦英国受到震慑，天下就太平了。
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第五章决定（1）
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法国将埃及列入殖民地并不是一个新计划，也不是荒谬的。因为荷兰人在远东，西班牙人在南美甚至南太平洋地区都有殖民地，当然还有英国，这个在坎波福米奥和约签订后惟一还在与法国为敌的国家，在世界几大洲都有殖民地。此外，法国的共和派感到他们有权利和义务将经过千辛万苦得来的革命果实传播到世界各地。
早在1769年，法国外交大臣就向路易十五提议将埃及变成法国的殖民地，以便“一旦丧失美洲殖民地，可以用埃及取而代之”。但是，该主张遭路易十五否决。数年后，另一位外交大臣又向路易十六重提此事，同样遭到拒绝。
日渐衰败的奥斯曼帝国已经失去了对偏远省份的控制。阿尔及利亚和突尼斯仅在名义上是奥斯曼帝国的成员，而由马穆鲁克统治的埃及的情况也好不了多少。
早在1796年4月，从土耳其回国的法国公使谈到奥斯曼帝国内部分崩瓦解，俄国和奥地利对其大有野心时，拿破仑就酝酿侵略埃及的计划了。但是，对进攻埃及态度最坚定的还要数法国富商夏尔·马嘉隆，由于他是常驻开罗的法国领事，他和巴黎、法国外交部，当然也包括督政府，有着密切的联系。
1797年8月，马嘉隆给巴黎递交了一份备忘录，指出占领埃及的必要性和利益。他建议法国选择5月登陆（以避开夏日的酷热和尼罗河的洪水期），他称“征服整个埃及可以并必须在9个月内完成。3个月的洪水季节可以用来巩固亚历山大港、塔米亚和罗塞塔”，为其后法军“进军印度和驱逐英国人”创造条件，至少能“切断英国商人和印度的来往”。而法国在埃及的新战略地位又会反过来使开罗、亚历山大和马赛一样成为法国新的世界贸易中心港口。1797年夏，马嘉隆的建议得到塔列朗的支持，蒙日鼓励拿破仑认真考虑征服埃及的冒险计划。然而，蒙日的出发点完全不同。他认为征服埃及是法国革命理想对愚昧和暴政的胜利——征服是法国的公民权。
另外，1797年整个春夏，得胜的拿破仑给巴黎的督政府递交了一系列国际政治形势分析。例如5月26日，他鼓励督政府夺取马耳他，称“该岛对我们具有无上的价值，如果我们裹足不前，它迟早会落入英国人之手”。他进一步说明法国新近占领的包括爱奥尼亚群岛和科孚岛在内的岛屿“比整个意大利的价值更大”，不仅因为这些岛屿“资源丰富，商业繁荣”，而且对于支持土耳其盟军有着重要的战略地位。但是，直到9月及10月和蒙日交谈之后，他的想法才得到进一步的充实，提出“为了真正摧毁英国，我们必须占领埃及”（他的冒险计划有点儿自相矛盾，一方面强调支持土耳其帝国的必要性，一方面又计划剥夺该帝国最富有的省份）。在与蒙日讨论之后，拿破仑决定派国库审计员秘密出使马耳他。
拿破仑在拉什塔特的外交作用逐渐淡化之后，便集中精力埋头致力于制订征服埃及的计划。3月5日，他提交了一份长长的分析远征行动的正式报告，包括他认为需要的兵力配备——25；000名步兵和3；000名骑兵——他认为这就“足以占领埃及和马耳他”了。
拿破仑的报告只是个形式问题，因为督政府早已和他商量并决定了这件事。同日，督政府颁发了一道法令，宣布发动一场新的军事行动，包括拿破仑提出的成立“地中海海岸军事委员会”指挥征战埃及的军事行动的主张。另一道命令授权对马赛、土伦和其他海港城市的军队进行补充，并组建护送远征军的舰队。同时授权陆军部长调拨100万法郎给新成立的军事委员会，并在此后每隔10天分别给陆军和海军拨款50万法郎直到完成备战为止。另外一道法令命令海军部长在土伦装备战舰，使它们能够胜任3个月的远海作战。督政府在同一天还发布了数道命令，指示驻意大利指挥官在热那亚征调所有船只准备运兵，并命令马塞纳将军立即启程到意大利契维塔韦基亚调兵遣将，同时命令在阿雅克肖的沃比翁将军整装待发。
虽然这项军事行动的目的是绝密的，连拿破仑的高级将领也只有少数人知道，调兵和运兵计划却在紧锣密鼓之中付诸实施了。
两天之后，即3月7日，督政府任命布吕埃斯海军中将担任舰队司令，同时继续为远征军准备兵力、弹药和大炮。几天后，贝尔蒂埃被解除其在意大利军的指挥官职务，调回巴黎任远征军参谋长。一周后，路易·德塞①接替了贝尔蒂埃在意大利契维塔韦基亚的职务。
3月中旬，陆军部长通知法国东部和东南部守军，在他们的军事辖区内将发生大规模的军事调动；他同时命令全法国和法国占领地的所有军事总指挥官向里昂调兵，然后由波恩将军组织和装备这些军队，并用成千上万艘驳船通过莱茵河运到地中海海岸。
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第五章决定（2）
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督政府对军事行动的目的讳莫如深，以至于从来没有和拿破仑共过事，而现在是远征军指挥官之一的克莱贝尔②至今还不知远征的终极目的地。更让人吃惊的是，海军部长本人直到3月15日还没有被告知远征的真正目的！
两周后，即3月30日，拿破仑通知法军总审计官（ChiefArmyOrdonnateur和军需司令官的地位、薪酬和重要性相当的一种官职）絮西宣布远征军将由5个师组成，需要两个月的食物和弹药，5个师的兵力分别从5大运兵口岸，即马赛、土伦、热那亚、阿雅克肖以及契维塔韦基亚集结登船，由多马丁将军指挥炮兵；医疗队由18名军医、300多名护士和药剂师组成，由医生德热内特和军医拉雷指挥。拿破仑于3月21日通知“地中海军事委员会”必须在4月9日以前将一切出发工作准备就绪，但各个海港都没有足够的运兵船，更不用说护送的舰只了，大部分船只是临时建造或修修补补的，此外，布吕埃斯海军中将尚在途中，实现计划谈何容易。
反对这次远征以及心存疑虑的远征军军官大有人在，因此半官方的报纸《箴言报》在4月1日发表的一篇文章上险些泄露了天机，该文称一次“兼有社会和军事性质的远征”正在成行，“其目的地是埃及。通过埃及进逼英国殖民地印度，要在那里打击英国。”与此同时，大部分拿破仑的军官，甚至连政府的高级官员都仍然被蒙在鼓里。为了弥补这一破绽，并进一步迷惑英国人，4月4日，《箴言报》上刊登了政府公告，称：“拿破仑将军将在10天内启程到布雷斯特担任英格兰方面军指挥官。”
海军舰队和护卫队显然没有能够按照命令在4月9日出发。在海上执行任务一年多的布吕埃斯的舰队已经离开科浮岛，但是还没有到达。此外，大部分军舰在经过数月的海上航行之后，都需要维修并对大量减员进行补充。尽管如此，当由6艘法国军舰、5艘威尼斯战船和9艘三桅快舰（其中6艘是法国的）组成的破烂舰队终于于4月2日在土伦抛锚停泊时，布吕埃斯仍然受到了热烈的欢迎。
然而，布吕埃斯和他的舰队所受到的欢迎是短暂的。离家一年多的布吕埃斯刚刚登岸便接到拿破仑和军事委员会的命令：他所指挥的舰队经过补给和载兵之后，必须向未知的目的港，“立即起航不得延误”。雪上加霜的是，委员会还通知布吕埃斯，由于海军�