行动进行得异乎寻常的顺利，德国战舰在2月11日23时45分出发，到天亮的时候已经绕过科唐坦半岛的阿格角，进入英吉利海峡。这一天的天气也很配合德国人，海峡上空云层低垂、朔风怒号，阻碍了皇家海军和空军的侦察。不过大白天航行在“女王陛下引水渠”（对英吉利海峡的戏称）中还是让德国水兵们精神紧张，但好运似乎一直跟随着德国人。10时14分，舰队驶过塞纳河口，接近多佛尔海峡，海峡对岸仍然毫无动静。
对德国人来说，第一次考验来自10时42分的一架英国轰炸机，这架“博福特”式飞机从舰队上空掠过，进行了一次失败的投弹攻击，并向基地报告了自己的发现。但英军基地根本不相信这份报告，给了德国人更多的时间。直到11时20分接到另一架飞机的报告，英国人才恍然大悟：德国舰队已经在眼皮底下了！
这时德舰队已驶入多佛尔海峡雷区，这是德国舰队最危险的时候，由于在雷区中无法机动，如果遭到攻击，将处于非常被动的状态，不过这时上帝仍然站在德国人一边，英国人的攻击姗姗来迟：12时，德国舰队驶出雷区20分钟后遭到第一次攻击，5艘英国鱼雷艇在烟雾掩护下冲向对手，但却无一能突破驱逐舰和鱼雷艇的屏障；12时18分，多佛尔炮台的岸炮也开火了，却只能在离德舰很远的地方制造一些巨大的水柱；13时25分，6架“箭鱼”式鱼雷机试图攻击德舰，但全军覆没，无一成功（领队的E&；#183；埃斯蒙德少校后来被追授维多利亚十字勋章）；此后几个小时内，皇家空军出动了多达550架次的轰炸机，但在德国海空军的凶猛火力面前无不铩羽而归；16时43分，一个英国驱逐舰中队（包括5艘驱逐舰）在鹿特丹外海再次试图攻击德舰，但德国舰队凶猛的火力驱散了它们，“欧根亲王”号的150毫米副炮击中了对方“沃斯特”号，该舰起火，但仍凭借自己的动力挣扎返回母港，英国驱逐舰仓促间施放的鱼雷则全部失的。
激烈的海空战一直持续到18时天完全黑下来，德国舰队趁着夜色一路猛赶，终于在午夜时分进入德国海域。眼看这次“海峡突破”就要获得圆满成功，“沙恩霍斯特”号和“格奈森诺”号却在下午和晚上先后触雷，后来不得不进坞修理，而“欧根亲王”号再一次全身而退，甚至连一颗炮弹都没有吃到。
2月13日8时，德国舰队抵达易北河口。
◆ 艰难的挪威之行
“海峡突破”获得成功还只完成了希特勒命令的一半，接下来德国海军水面舰队的主力将前往挪威，在那里迎击希特勒“直觉”中的盟军进攻。
由于“沙恩霍斯特”号和“格奈森诺”号都触雷受伤，需要进坞维修。奥托&；#183；西里亚克斯中将把自己的旗舰搬到“欧根亲王”号上，继续指挥向挪威的转移，“舍尔海军上将”号袖珍战列舰加入了转移的行列。为掩护转移，德国人进行了一系列欺敌行动。2月21日12时10分，两舰在5艘驱逐舰的掩护下驶离威廉港，向北进发。
德军的欺敌措施显然收到了很好的效果，加上2月份北海风雪交加天气的掩护，德国舰队“消失”在英军的视野里。直到22日下午，英国侦察机才重新找到德舰，但随后的攻击同样毫无成果。“欧根亲王”号的好运似乎也感染了整个舰队，这次转移似乎将一帆风顺地结束。
也许是为了来一点小小的考验，上帝给德国人开了个玩笑。23日7时，当目的地特隆赫姆已经在望的时候，“幸运战舰”碰到了一点不幸：四艘埋伏在特隆赫姆外海的英国潜艇发现了德国人，其中的“三叉戟”号向“欧根亲王”号来了一次鱼雷齐射，一条鱼雷击中舰尾。巨大的震动把12台锅炉的安全阀全部震开，舰尾几乎折断，垂入水中，方向舵也被卡死在左舷10度的位置，幸运的是轮机和螺旋桨没有受伤。
西里亚克斯中将在两周内第四次转移旗舰，早已在特隆赫姆恭候的“提尔皮茨”号战列舰成为新的旗舰。“欧根亲王”号展开紧急抢修，驱逐舰则在周围提防英国潜艇新的攻击。2小时后，重巡洋舰终于能再次航行，布林克曼上校施展了出色的控制能力，通过调整两侧螺旋桨的转速保持航向，“欧根亲王”号歪歪扭扭地驶入特隆赫姆。
在港口里，布林克曼上校和他的部下才得以确认战舰受损情况。检查发现，“欧根亲王”号受到两处重要损伤：舰尾受损下垂，舵被卡死。此外，舷侧和舰底的部分装甲也有不同程度的损坏。工程师们商讨修理方案的时候，水兵们为丧生的五名士兵举行了葬礼，他们被埋葬在特隆赫姆覆盖着皑皑白雪的军人公墓。
德国海军的工程师判定，“欧根亲王”号的舰尾需要更换，舵和舵机也需要大修，而这些工作都必须在干船坞里完成，这意味着“欧根亲王”号刚到挪威就得准备返航。不过在此之前仍然需要做很多工作，重巡洋舰需要进行一些临时性的修理，才能保证它自己驶回基尔。
维修人员立即开始修理，从2月到3月，人们把受损的那部分舰尾从舰体切割下来，避免浸在水里的舰尾对航行造成影响。之后，工程师们又试图解决方向舵的问题，由于特隆赫姆没有足够大的干船坞，更换舵显然比较困难，于是人们想出一个变通的办法：在截短后的舰尾安装两个较小的舵，操舵的钢索连到舰尾部的一个绞盘上，通过电力驱动绞盘来转舵。紧急情况下，水兵们也可以用人力推动绞盘调整舵角。
对战舰的紧急修理一直持续到5月初，几个月的时间只能困在港口，让水兵们闲得无聊。德国水兵似乎重温了前一年在布雷斯特的美好时光，同样的无所事事，同样有经常可以看到的英国飞机轰炸表演，“欧根亲王”号甚至还照顾了几个英国战俘——一架被击落的英国轰炸机机组成员。但布林克曼上校可不打算让水兵们这么清闲，考虑到返回基尔的航程中可能有需要人力操舵的时候，上校为自己的部下制定了严格的训练计划，包括射击、体能训练、野外拉练、越野滑雪训练，甚至还有徒手搏斗科目，以保持舰员具备良好的体能。
4月底，临时舵安装完毕。5月初，“欧根亲王”号开始准备试航。
第一次试航就表现出战舰的一些问题：航速降低了不少，操纵性能也有下降，转弯半径是原来的两倍，而且在航速低于18节时，舰体会侧向一边。这次试航中还进行了人力操舵试验，20名水兵拼尽全力推动绞盘，使军舰转向。布林克曼上校对部下两个多月的训练收到了效果，试验表明，即使用人力操舵，军舰也可以保持28节的航速。这是全体舰员信心大增。
此后十几天中，“欧根亲王”号在驱逐舰的掩护下多次进行试航。5月16日，该舰与驱逐舰一道驶出港口，一切似乎与平时的试航一样，但这次“欧根亲王”号真的踏上了回基尔港的征程。这次行动代号为“魔笛”。
挪威的春天开始日长夜短，天气也逐渐好转起来，这一切似乎都不利于“欧根亲王”号的旅程。5月17日，危机果然来临，英军发现了正在斯卡格拉克海峡航行的德国战舰，24架轰炸机攻击了这支小小的编队，随后又来了27架鱼雷攻击机。德国水兵疯狂对空射击，但英国飞机仍努力投下****和鱼雷，海面上顿时布满了冲天的水柱和无处不在的鱼雷尾迹。这时“幸运战舰”充分展示了它决非浪得虚名的运气，靠着不断的转舵和躲闪，这些****和鱼雷居然无一命中，据统计，它至少躲过了12条鱼雷和更多数量的****。在空军战斗机的帮助下，“欧根亲王”号的小编队躲过这一劫，于18日傍晚安然抵达基尔港。
5月到10月，“欧根亲王”号再次上了干船坞，水兵们又得到一个长假。在此期间，舰长布林克曼也离开了这艘重巡洋舰，他于9月1日晋升为少将，调往海军南方集群担任参谋长。由于在干船坞呆了5个月，基本没有什么事务可以管理，布林克曼的先后两位继任者都只是代理舰长：诺依鲍尔中校和贝克少校。
10月20日，“欧根亲王”修理完毕，在11天前上任的新舰长汉斯…埃里希&；#183；沃上校的指挥下开往波罗的海，并在那里试航到12月。
1943年1月，该舰再次得到前往挪威的命令，这次同行的是“沙恩霍斯特”号战列巡洋舰。9日，两舰在三艘驱逐舰护卫下离开格丁尼亚，试图再次穿越卡特加特海峡和斯卡格拉克海峡，前往挪威北部的纳尔维克。已经被德国海军和“欧根亲王”号羞辱过好几次的皇家海空军这次注意力很集中，英国飞机于11日发现德国人的企图，并派出潜艇、巡洋舰和驱逐舰在挪威海严阵以待，德舰被迫返航。23日，德国人准备再碰碰运气，但这段时间运气显然不在他们这边，半路又被英国飞机发现，于是只能再次返回。
这也是“欧根亲王”号最后一次前往挪威的尝试，艰难的挪威之行就此结束。
◆ 困斗波罗的海
就在1943年1月，海军总司令雷德尔海军元帅提出辞职，接替他的是卡尔&；#183；邓尼茨。这对德国海军水面舰队来说是一个重大打击，面对希特勒“拆毁所有大舰”的咆哮，每一个水面舰队的成员都感到提心吊胆。“欧根亲王”号在这种气氛中迎来了它的第三位舰长：韦尔纳&；#183；艾尔哈特海军上校。
前往挪威的尝试失败后，“欧根亲王”号转而在波罗的海从事训练任务，没有参加“沙恩霍斯特”号驶往挪威的第三次尝试（这次尝试虽然成功，但也使“沙恩霍斯特”号最终命丧北角海战）。在邓尼茨对水面舰队的调整中，“欧根亲王”号被编入训练舰队，并担任旗舰，直到战争结束。
整个1943年剩下的时间和1944年上半年，“欧根亲王”号都在波罗的海执行索然无味的训练任务。其间可以称得上重大的事件只有两件：1943年秋天测试新的武器装备；1944年1月6日迎来了新一任舰长，也是最后一任德国舰长汉斯…约尔根&；#183；莱尼克海军