，这一行动使日本对东印度的前途又产生了新的紧张和怀疑。罗斯福和赫尔立刻劝说英国政府声明没有占领东印度的任何意图，一面劝说荷兰政府否认有要求这种援助的打算。
5月16日，赫尔同日本大使堀内进行了长时间的严峻的会谈，堀内向他详细地询问了有关荷属西印度的情况。赫尔确信日本政府正在试图寻找借口，对东印度进行干涉，他认为，如果美国政府不是从一开始就采取坚定的立场，如果它不是立刻就向英法两国施加压力，强使它们否认有进军荷属东印度的意图，那么日本人非常可能在1940年夏天就已向东印度进军了。
不过，看来赫尔是夸大了日本想立刻进行侵略的意图。日本当然是觊觎东印度的，并且希望有朝一日占有这些地方，但是它尚未准备好作如此冒险，因为这样做几乎肯定会同英国打起来。1940年8月10日，木户在日记中写道，海军军令部长伏见亲王说，海军希望目前避免对荷属东印度和新加坡用兵，另外，即使作出这样进攻的决定，至少也需要八个月的时间进行准备，因此仗越迟打越好。同时，看来军方虽然不喜欢米内内阁努力想与英美达成和解的做法，并且正在策划推翻这个内阁，但是在中国事件获得解决和苏联的意图变得更加明确之前，它并不希望日本卷入战争。日本人其实是色厉内荏：日本政府在1940年春天正为了海外供应的原料，尤其是石油、橡胶和锡而担忧。英国和法国的战时需要，使这两个国家限制从它们的殖民地输出原料到日本，而日本同美国的经济关系则仍然处在不稳定的状态，美国随时可能禁运石油和其他出口品到日本。假如荷属东印度受到英国或美国的控制，则该地区对日本的供应也可能受到限制。日本希望在它尚未准备好进入东印度之前，不让任何人进去。因此，它一方面坚持要维持那里的现状，另一方面又不喜欢美国提出的建议，要日本和美国互换照会，来保证欧洲各交战国在太平洋上所辖领土的现状。
随着德国在欧洲的节节胜利，先是低地国家，随后是法国，都被希特勒的军队打垮，东京又为德国在远东和太平洋的意图发愁。德国如获全胜，是否会强逼战败国割让它们在太平洋地区的殖民地，而不顾日本在那里的权益呢？由于日本没有参加轴心国，德国对它不负有义务，甚至可能不能忘怀它曾努力同英美保持友好关系而怀恨在心。德国政府并不急于对日本在5月11日采取的措施作出答复。直至日本方面通过它驻柏林的大使提醒此事以后，德国政府才指示驻东京的奥特，要他说明，德国政府对“荷属东印度问题不感兴趣”。奥特在5月20日照办了。但未能消除日本对东印度的忧虑，它对东南亚和整个太平洋根本不放心。
法国的崩溃使法属印度支那的问题突出了。6月19日，日本政府要求暂时封锁印度支那与中国的边界，禁止过往交通，要求法国当局同意日本派去检查员，以保证永远禁止任何可能助长重庆作战能力的过境运输。法国政府于6月20日答复说：它在6月17日就已封闭了边界，不让供应的汽油和卡车通过；将把禁运的范围扩大到包括许多其他物资；不反对日本派检查员。29日，由西原将军率领的一个日本代表团到达河内，着手在海防、河江、老街、高平、谅山、贝亚尔堡建立检查站。但是，日本人的欲望远远不止这些。6月19日，日本外务省欧洲司司长告诉奥特说，已指示日本驻柏林大使来栖强调指出法属印度支那的前途对日本有特殊利害关系。他向奥特解释，这意味着日本想要德国让它在印度支那放手行动，并且可能还想要德国为此而向维希政府施加压力。在柏林，来栖6月19日谈到日本的一位前任外相佐藤尚武将去访问，又对欧洲新秩序和亚洲新秩序在战后的经济合作大肆吹嘘了一番。6月24日，奥特报告，日本陆军省中央课课长武藤彰将军告诉德国驻东京的武官说，日本军队欢迎德国进行调停，以结束中国战事，同时为了这个缘故，日本对印度支那也非常感兴趣。日本拓务相小矶将军还就印度支那问题向奥特本人进行了试探。武藤和小矶还向对方详细论述了缔结俄日互不侵犯协定的可能性。他们的想法显然是，日本若同苏联达成协议，同时又占领了印度支那，那么蒋介石在发现自己陷于孤立之后，可能会同意缔结日本所希望的那种和约，特别是如果让他在印度支那分得一杯羹以进行收买的话。但是，柏林对日本的这些建议很冷淡。奥特在6月19日的电报中，表示对米内和有田不信任。他认为这两个人想同英美搞妥协。他建议德国不要立刻发表声明把印度支那交给日本，这样也许能导致米内内阁垮台，而由一个“亲我们”的内阁取而代之。6月24日，奥特答复小矶说，德国大概不会反对日本在印度支那采取行动，只要日本保证在太平洋牵制美国，也许还应当允诺，万一美国干涉欧洲战事，日本就向菲律宾和夏威夷进攻。
德国外交部对于奥特的建议很容易地就接受了，特别是因为它对日本默许英法封锁德国的做法怀恨在心。经济司司长维尔说，日本直到不久以前才让少量的原料如锡和钨经过其领土运至德国。他还说，日本在1940年1月不通知德国就同满洲国缔结了一项独家经售满洲大豆的协定；而且，它不顾德国的抗议，迄今只向德国输送了七万吨大豆。他认为，德国为了停止供应中国战争物资而得不到宝贵的中国原料，日本却恩将仇报。德国外交部的另一个官员克诺尔在6月20日的备忘录中说，最好告诉佐藤，在从东亚获得原料供应方面，德国希望日本有比较恳切的态度。
7月8日，佐藤同里宾特洛甫会晤（在座的还有来栖和里宾特洛甫的私人代理施塔默尔）。佐藤声称，由于日本在远东的行动转移了英、法、美三国政府的注意力，使德国的任务执行得更加顺利。他说，日本正努力在亚洲建立新秩序，象德国在欧洲所做的那样，他说，今后两国应密切合作，尤其是在美国干涉欧洲或远东事务的时候。日本正在设法结束中国战事，以腾出手来为上述目标奋斗。然后佐藤提到，法属印度支那和荷属东印度的前途使日本忧虑不安。里宾特洛甫在答话中没有许诺什么。他提到1939年三国公约谈判的失败。他说，谈判之所以失败，“正如日本一些政治家最近在讲话中再次表明的那样”，是由于日本对欧洲事务不感兴趣，因此这时根本不明白，日本说要加强德日合作是什么意思。
有田急切地向佐藤了解，德国究竟是对法国和荷兰在远东的殖民地有野心呢，还是要利用这些地方作为诱饵使日本参战？佐藤回答说，他猜想这两种念头德国都没有；德国这时似乎并不怎么在乎日本参战。但是里宾特洛甫却告诉来栖，传说德国对日本态度冷淡，纯是无稽之谈，他对日本所提的两国之间应就合作问题更明确地交换意见的建议，反应也很良好。
佐藤未能使德国在印度支那和荷属东印度问题上作出更明确的保证，里宾特洛甫暗示，希望日本提出更具体的办法，结果日本外务省草拟了一份德日协定的大纲，并同陆海军的代表进行了讨论。草案提出德国应承认南洋地区，包括法属印度支那和荷属东印度在内，是日本势力范围的一部分，并应支持日本在这一地区的霸权。德国还应帮助日本处理中国事件，给予日本与欧非集团通商的优惠待遇。作为报答，日本应承认德国在欧洲和非洲的霸权，日本虽不参战，但应采用各种手段协助德国迫使英国投降，并给予德国与大东亚通商的优惠待遇。两国应共同合作维护同苏联的和平，但如其中一国受到苏联的威胁，两国应共同协商采取措施；如果其中一国同苏联开战，另一国不得给予苏联援助。德国和日本还应共同合作来防止美国干涉它们各自在欧洲和亚洲推行的政策。同意大利也要商谈一个大致相同的协定。
7月12日和16日在东京讨论这些建议时，参加会议的外务省和军方的人员都对德国未来的政策表现出优虑不安。他们怀疑德国谋划使东印度纳粹化，或在和平解决时并吞其中的一部分。他们对德苏关系的前景也有疑问，并表示出有些担心，日本若不经过德国的同意就向南进军，可能会遭到俄国的敌对行动，这种行动或许还是德国怂恿的。因此，大家一致同意按照所建议的方针同德国和意大利接触。但是，米内内阁的倒台，使这些计划未能立刻开展。
1939年下半年，诺门坎停战以后，日苏关系稍有改善。10月27日，两国达成协议，互相释放因偷捕鱼罪而被扣押的渔船。11月6日，斯麦塔宁以苏联驻日大使的身分赴任，标志着两国紧张关系的进一步缓和。在莫斯科，日本大使东乡同苏联副外长洛佐夫斯基会谈的结果，达成一项协议，组织一个俄日联合委员会，来解决外蒙古与满洲国之间以及满洲国与苏联之间的边界问题。该委员会于12月7日在赤塔举行第一次会议，此后又经过七次会议，于12月25日在程序问题上达成了协议。然后委员会迁往哈尔滨，着手进行划定边界的实际工作。
东乡开始了为缔结长期捕鱼协定和通商条约而进行谈判，在这两方面也都取得了进展。缔结商约的初步商谈结果，于11月19日在原则上达成协议，随后再由东乡及驻瑞典公使松岛和外务省商业局的一位前任局长与莫洛托夫和苏联外贸人民委员米高扬在莫斯科继续举行会谈。12月31日，苏日达成了一项暂时解决办法，规定在缔结长期条约之前，把原有的捕鱼协定延长一年，还规定购买中东铁路的最后一次分期付款必须交齐。但是，这些很有希望的进展，在1940年春天却受到了阻碍。苏日边界委员会于1月5日至30日在哈尔滨举行了八次会议以后，在诺门坎地区的问题上完全陷入了僵局，因为�